Il Cisui pubblica la rivista Annali di storia delle università italiane
dal numero 1 al numero 18 pubblicata da Clueb
dal numero 19 in poi pubblicata da Il Mulino
Il Cisui pubblica due collane di studi:
la collana Studi pubblicata da Clueb
la collana Studi e ricerche sull'università pubblicata da Il Mulino
