Il Centro interuniversitario per la storia delle università italiane (Cisui) è stato creato nel 1996 da un gruppo di studiosi appartenenti alle Università di Bologna, Padova, Torino, Messina e Sassari con l’intento di incrementare le attività di ricerca nel settore della storiografia universitaria. Il Cisui si è proposto, fin dalla sua fondazione, come struttura di coordinamento fra i diversi Istituti e Centri che operano nel settore della storia universitaria presso i vari Atenei. In questi anni le adesioni sono cresciute ed oggi al Cisui fanno capo gli studiosi di 27 università: Bari, Bologna, Brescia, Catania, Chieti-Pescara, Enna “Kore”, Ferrara, Genova, Macerata, Messina, Milano “L. Bocconi”, Milano Politecnico, Modena e Reggio Emilia, Università della Campania “L. Vanvitelli”, Napoli Federico II, Padova, Parma, Pavia, Perugia, Pisa, Sassari, Siena Stranieri, Torino, Torino Politecnico, Trento, Università della Tuscia, Verona.
Il Cisui ha sede, ai fini organizzativi e amministrativi, presso l’Università di Bologna. Le sue attività sono coordinate da un Direttore, un Consiglio di gestione e un Comitato scientifico.