Il Centro Interdipartimentale di Ricerca per le Scienze Ambientali (CIRSA) è stato fondato il 30 ottobre 2000, dai Dipartimenti di Biologia, Chimica, Geologia, Matematica e Fisica dell'Università di Bologna con DR 28/96, ed ha avviato la propria attività il 1 gennaio 2001.
Il nuovo Statuto dell'Università di Bologna 2012 (articolo 25) ha riorganizzato i centri di ricerca interdipartimentali.
Nel 2015 è stato costituito il CIRSA, promosso dai 6 dipartimenti: Chimica, Fisica e Astronomia, Matematica, Scienze Biologiche Geologiche e Ambientali, Ingegneria Industriale, Beni Culturali.
Dal 2014 la sede amministrativa del CIRSA è presso i Laboratori Sartori di Ravenna.
Il CIRSA svolge principalmente funzioni di istruzione superiore e di ricerca nel campo delle Scienze Ambientali e della Biologia Marina. I suoi obiettivi principali sono:
Il Direttore è designato dal Consiglio e può essere eletto tra gli stessi membri o tra i docenti in servizio presso l'Ateneo. Il Direttore dura in carica tre anni e la carica può essere rinnovata consecutivamente una sola volta.
Il Consiglio è composto dal Direttore, che lo presiede, e dai Direttori dei Dipartimenti partecipanti o loro delegati, individuati tra i docenti e i ricercatori del Dipartimento di competenza.